单细胞分析技术对生物医学研究意义重大,目前在单细胞组学中,基因组学和转录组学技术相对成熟,单细胞转录组学和蛋白组学分析技术近年来获得越来越多的关注和投入。与其他组学相比,单细胞脂质组学分析刚刚起步,面临诸多技术难点。近期,威斯康星大学麦迪逊分校的李灵军教授团队报道了离子淌度(IMS)与双极性离子化质谱成像相结合的单细胞脂质组学方法,实现了单细胞脂质组高通量、原位和双极性成像,揭示了小鼠小脑皮质细胞层特异性脂质分布。
该项工作以“Single-cell lipidomics enabled by dual-polarity ionization and ion mobility-mass spectrometry imaging”为题发表在Nature Communications(https://www.nature.com/articles/s41467-023-40512-6),文章第一作者为张华博士。
该研究实施了捕集离子淌度分离(TIMS)与双极性电离(dual-polarity ionization)以及质谱成像(MSI)相结合,以实现单细胞(SC)脂质组的高通量原位分析。使用来自单培养和共培养的人胰腺癌 (PANC-1) 和活化的胰腺星状细胞 (PSC) 以及神经母细胞瘤细胞 (SK-N-SH) 的 SC 样本的 MSI 分析来评估该方法的性能;使用 MALDI 捕集离子淌度飞行时间质谱(MALDI-timsTOF-MS) 平台进行分析。研究结果表明, 高分辨率 MALDI-MSI 可为单细胞分析提供良好的重现性和质量准确度。整体来说,该研究建立了单细胞脂质组学分析的新技术,为揭示细胞间及细胞内脂质异质性研究提供了重要工具。
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